Zarządzanie zasobami w firmie wykonawczej wymaga prowadzenia bieżących rozliczeń realizowanych inwestycji, które uwzględniają okresy lub etapy prowadzonych robót. Rozliczenie robót może być dokonane po ich zakończeniu lub w formie częściowych rozliczeń w trakcie trwania przedsięwzięcia budowlanego.
Podstawą do rozliczeń jest kosztorys ofertowy, w przypadku kontraktu obmiarowego dokonujemy rozliczenia faktycznego postępu robót każdego z elementów robót. Wykaz robót wykonanych w danym okresie rozliczeniowym stanowi podstawę umożliwiającą wystawienie przez wykonawcę faktury. BUDin pozwala na częściowe rozliczenie robót w postaci oceny procentowego zaawansowania robót dla poszczególnych pozycji.
Takie rozliczenia w razie potrzeby można stosować dla kontraktów ryczałtowych. W programie dane wprowadza się w oparciu o pliki przygotowane w programie do kosztorysowania lub arkuszu kalkulacyjnym Excel. Wszystkie dane są w pełni modyfikowane w trakcie całego procesu inwestycyjnego. Każdy okres rozliczeniowy znajduje swoje odbicie w generowanych przez program różnorodnych raportach dostępnych w formie wydruków.